Para el a�o 2001 el Isidro Menendez se fusiona con el Metap�n F.C. y nace el glorioso equipo A.D. Isidro Metap�n que logra el campeonato tras derrotar al C.D.Jocoro. en la final y se logra la segunda clasificaci�n a la primera divisi�n en la historia de la mano del tecnico Edwin Portillo.
El presidente del equipo era el ya fallecido Gumercindo Landaverde.